自然保護區的水平地帶性土壤是紅壤。土壤的形成主要受復雜的地形地貌，垂直分布的生物氣候及不同植被類型的影響，并且由于自然景觀的復雜多樣加上東西坡自然條件的差異明顯，使各土類之間交錯分布和鑲嵌的現象較普遍，成為保護區土壤多樣性的一個具體表現。保護區土壤主要是以花崗巖和板頁巖發育而成的山地紅壤和山地黃壤。土壤的垂直分布差異明顯，分為山地紅壤、山地黃紅壤、山地黃壤、山地黃棕壤、山地草甸土等5個土壤亞類。